Setelah berakhirnya Operasi Pemusnahan Keluarga Tsukiyama, anggota Komisi Counter Ghoul (CCG) telah tumbuh secara eksponensial dalam kekuasaan dan terus mengejar tujuan mereka untuk memusnahkan setiap hantu di Jepang. Setelah mengundurkan diri dari Quinx Squad, Haise Sasaki yang sekarang tampaknya tanpa emosi mulai mengambil lebih banyak tugas dari CCG tanpa memperhatikan kesulitannya. Meskipun ekspresinya kosong, ingatan Ken Kaneki muncul kembali di Haise, meninggalkannya dalam keadaan konflik internal. Sementara itu, perilaku barunya yang berhati dingin mempengaruhi orang-orang di sekitarnya. Quinx Squad dibiarkan berantakan, harus menghadapi kematian salah satu anggota mereka tanpa dukungan dari mantan mentor mereka.
Di tengah gejolak ini, baik Quinx Squad maupun Haise harus tetap menjalankan tugasnya di CCG, mau tidak mau. Namun, kehadiran kelompok misterius di belakang CCG telah diketahui Haise, dan bisikan korupsi tertentu juga tidak terdengar oleh Pasukan Quinx.
